一、
 ID是设计的时候所指定的ID。

ClientID是当这个控件生成到客户端页面时候，需要在客户端访问时候用的。

UniqueID是当需要参与服务端回传的时候用的。

备注：当控件是子控件的时候（例如在用户控件中的Button），ClientID在HTML页面中是作为控件的ID属性，UniqueID是作为控件的Name属性，如果不是子控件，那么ClientID和UniqueID是相同的

例如：

MyControl1是一个用户控件，里面包含一个ID为Button1的按钮，把MyControl1放在一个页面中运行，下面是其页面的HTML代码

<input type="submit" name="MyControl1:Button1" value="Button" id="MyControl1_Button1" /> ClientID：MyControl1_Button1 UniqueID：MyControl1:Button1

补充：当要编写用户控件中一个控件的客户端事件代码时，如果想在用户控件内编写必须要获取该控件的ClientID。

二、ASP.NET 的服务器端控件有三种关于 ID 的属性 ID, ClientID 和 UniqueID。

ID 
        表示控件的服务器端编程的标识符，我们写服务器端的代码，就要用到这个 ID, 通过这个 ID  可以在服务器端对服务器端控件的属性、方法和时间进行编程访问。

ClientID  
       表示由服务器端生成的客户端控件的ID,经常用于在客户端脚本中访问服务器控件所呈现的HTML元素。
       一般情况下与服务器端的ID相同，有时，不能为控件生成唯一的名称，例如：
       如果 Repeater 空间在它的某个模板中包含一个 Label 控件，则将在客户端生成多个该 Lable 的  HTML 元素,
       为防止命名冲突，ASP.NET 为各个服务器控件生成一个唯一的 ClientID ,ClientID 通过将子控件的父控件的 UniqueID  值与控件的 ID 值连接生成，各个部分之间以下划线 _ 连接。

UniqueID  
       用于获取服务器控件的唯一的、以分层方式表示的标识符。
       当将控件放置到重复控件（Repeater、DataList和DataGrid）中时，将可能生成多个服务器端的控件，这就需要区分服务器端的各个控件，以使它们的ID 属性不冲突。
       UniqueID 通过将子控件的父控件的 UniqueID 值与控件的 ID 值连接生成，各个部分之间以 IdSeparator  属性指定的字符连接。
       默认情况下， IdSeparator 属性为冒号字符 (:)。此属性为在 .Net  Framework2.0种新增加。