MATLAB的最新版本2006b中新添了一个产品－MATLAB Builder for Java。其实本来Matlab就有Java外部程序接口，不过原来的接口只能在.m文件中调用Java，而无法在Java程序中调用Matlab。
新的 Java Builder为我们在Java程序中调用Matlab丰富的数值计算资源提供了极大的便利。
与MATLAB对其他程序的外部接口相比，我觉得Java接口在一下几个方面比较有特色：
（1）在.m文件中可以直接调用Java资源。例如可以调用JDK中的界面元素构建用户界面。
（2）可以利用Java在网络功能方面的优势，开发基于Web的应用程序。
1首先你需要一个版本的matlab至少2006版本，看看你的matlab安装文件夹下toolbox中有没有javabuilder这一 项，如果有go to 2， 没有可能是该toolbox没有安装把。推荐一个下载地址，matlab2008
http://www.jliae.edu.cn/ele/Soft/ShowSoft.asp SoftID=60，很快，100k/s，用了4-5小时下完
2 配置java环境， 要装JDK（1.5版本以上，所有java程序的编译和运行都需要安装这个环境）。搞清楚JDK的安装的路径，比如我的是C:\Program Files\Java\jdk1.6.0_03，打开你的dos命令窗口，开始设置。
2.1键入set JAVA_HOME=C:\Program Files\Java\jdk1.6.0_03
键入set PATH=%PATH%;C:\Program Files\Java\jdk1.6.0_03
2.2 检查配置是否成功
键入 java -version
应该有
java version "version_number"
Java(TM) 2 Runtime Environment, Standard Edition
(build version_number.build_number
Java HotSpot(TM) Client VM (build version_number.build_number, mixed mode)
键入javac -version
返回 javac version_number
2.3 最后在matlab的窗口键入 ：getenv JAVA_HOME：，应该返回 JDK的路径
如果以上都没有问题，那么java环境配置就完成了
3 在matlab的command窗口，输入 deploytool。会在右侧弹出一个新窗口（Deployment Tool），也可以 new-〉deployment 选择跳出这个界面。以matlab自带的magicsquare的例子。
新建工程 magicsquare。建立一个m文件命名makesqr，内容见下面
function y = makesqr(x)
%MAKESQR Magic square of size x.
% Y = MAKESQR(X) returns a magic square of size x.
% This file is used as an example for the MATLAB
% Builder for Java Language product.
% Copyright 2001-2006 The MathWorks, Inc.
y = magic(x);